במהלך ההכנות בישראל לתקיפת מתקני הגרעין האיראן, שכונו בצה"ל "מבצע הילה", התקיימו בצמרת מערכת הביטחון לפחות 14 דיונים בהשתתפותו של שר הביטחון ישראל כ"ץ - מדיון ההכנה עם פורום המטה הכללי ב-11 בנובמבר 2024 ועד 9 ביוני 2025, ימים ספורים לפני פתיחת המערכה.
בין היתר נידונה השאלה אם ארצות הברית תצטרף לתקיפות לצד ישראל ואם תיתן "אור ירוק" לתקיפה ישראלית עצמאית על אדמת הרפובליקה האסלאמית.
במשך חודשים ארוכים שיפר חיל האוויר את יכולותיו המבצעיות כדי להגיע למצב שבו מטוסי הקרב הישראליים מסוגלים לתקוף בשמי איראן.
ב-23 בינואר השנה קבע שר הביטחון את ההישג הנדרש למערכה באיראן: "ביטול יכולת פיתוח של נשק גרעיני איראני לפרק זמן מסוים, באופן שיחייב את איראן לקבל החלטה על התועלת בשיקום וחידוש הפרויקט. עצם התקיפה תיצור הרתעה משמעותית שתוביל להקפאת הפרויקט".
במשך שבועות ארוכים דנה צמרת מערכת הביטחון באפשרות שארצות הברית תצטרף למערכה, וההחלטה הייתה להסתפק, לכל הפחות, ב"אור ירקרק" - אישור אמריקני בסיסי לתקיפה ישראלית מתוך הבנה שבסיסים אמריקניים עלולים להיפגע במתקפת-נגד איראנית.
ישראל עדכנה את ארצות הברית ברצונה לפגוע במתקני הגרעין של איראן ובפרויקט הטילים שלה. בדרג הבכיר היו ארבעה שומרי סוד שריכזו את המתקפה באיראן: ראש הממשלה בנימין נתניהו, שר הביטחון ישראל כ"ץ, השר לעניינים אסטרטגיים רון דרמר והרמטכ"ל אייל זמיר.
היום נחשף מבצע "טורנדו" בשמו. מדובר במבצע שנבנה בהנחייה ישירה של השר כ"ץ לצה"ל ומטרתו "להרוס את טהראן". המטרה הייתה לפגוע במבנים ובתשתיות בבירת הרפובליקה האסלאמית כדי ליצור מאזן הרתעה נגד איראן, מחשש שתוציא מתקפה רחבה לעבר העורף הישראלי.
ב-29 במאי, כשבועיים לפני פתיחת המערכה, אושר המבצע. בסיומו של הדיון הביטחוני נקבע: "כלי תגובה מול ירי איראני עצים ומכוון לעבר מרכזי אוכלוסייה בעורף, מתוך היגיון של הרעה, וכלי נוסף לסגירת המערכה".
ב-9 יוני נקבע מועד התקיפה - יום חמישי, 12 ביוני. בהערכת מצב שהתקיימה הוערך כי רוב הבכירים האיראנים, גנרלים ומדענים, ישהו בבתיהם לקראת תפילות יום השישי המקודש באיראן.
לדברי שר הביטחון, ישראל השיגה "מעל ומעבר" במערכה באיראן. זאת, בין היתר, בזכות הצטרפותה של ארצות הברית לתקיפת מתקני הגרעין באמצעות מפציצי B2. השר כ"ץ אמר: "פגענו בצורה אנושה ביכולת הגרעין והטילים של איראן".
בלשכתו של כ"ץ אומרים שהחל תהליך אכיפה במטרה לשמר את העליונות האווירית ולהמשיך לאסוף מודיעין על כוונותיהם של בכירים באיראן בתחום הגרעין והטילים. בישראל אומרים שהסכנה הקיומית מהגרעין הוסרה, אך גם כי נושא ייצור הטילים אמור להעסיק את ישראל בתקופה הקרובה.
כ"ץ מגבה את הרמטכ"ל בעניין עזה: "צה"ל לא נמצא בוויכוח"
בנושא עזה אומר השר כ"ץ כי צה"ל עושה עבודה "מדהימה" וכי בקרוב ישיגו הכוחות שליטה מבצעית בכ-70% משטח הרצועה.
לפי המדיניות שקבע הדרג המדיני לצה"ל, הכוחות כובשים שטחים מבלי לסכן חטופים. בצמרת מערכת הביטחון אומרים כי לולא המדיניות שנועדה להגן על חייהם של החטופים, כוחות צה"ל היו מתמרנים יותר בחופשיות.
כ"ץ הורה למנכ"ל משרד הביטחון ולצה"ל להכין תוכנית להקמת עיר הומניטרית בדרום הרצועה, על חורבות רפיח, שאמורה לאכלס כ-600 אלף פלסטינים מאזור המואסי. המטרה היא להכניס את הפלסטינים פנימה, אחרי בידוק, ולא לאפשר להם לצאת.
בהמשך, על פי התוכנית, תרוכז באזור כל אוכלוסיית עזה. צה"ל יאבטח את האזור מרחוק, וישראל מנסה לרתום למהלך גם גורמים בינלאומיים שיסייעו בניהול.
בישראל אומרים כי העבודות על העיר ההומניטרית יחלו, במידת האפשר, בזמן 60 הימים של הפסקת האש המסתמנת.
ברקע העימות החריף בין השר בצלאל סמוטריץ' לרמטכ"ל זמיר, שר הביטחון כ"ץ מגבה את הרמטכ"ל. "אין מה לתקוף אותו, צה"ל לא נמצא בוויכוח. צה"ל לא ינהל את המתחם ולא יחלק מזון. הוא יאבטח את המקום בזמן הקמתו. מדובר צעד להכרעת חמאס", אמר כ"ץ.
