חודשים לפני שהחלו לחקור את פרשת ההברחות לעזה, גורמים ביטחוניים התריעו חודשים ארוכים על פרצות אבטחה בשערי הכניסה לרצועה והזהירו שיש גורמים שמנצלים אותן - כך פורסם הבוקר (שני) בכאן חדשות ברשת ב'. ההתרעות הובאו בפני גורמים שונים, גם בדיונים סגורים – אך בפועל, לטענת אותם גורמים, הטיפול לא היה מספק.
מדובר בכמה שערים צדדיים שהובילו למוצבים צבאיים – שערים דרכם מועברת לוגיסטיקה, ציוד רפואי, כוחות הנדסה וכוחות צה״ל, וכן צירים שצה״ל הקים והפעיל לטובת תנועה מבצעית.
בניגוד לשער המרכזי בכרם שלום, שבו המשאיות עברו בדיקות קפדניות, השערים הצדדיים הפכו עם הזמן לנקודת תורפה. גורמי ביטחון מעריכים כי גורמים עוינים ניצלו את הפערים בפיקוח, ובאמצעותם הועברו סחורות בהיקף משמעותי – מבלי שצה״ל זיהה זאת בזמן.
לפי אותם גורמי ביטחון, חמאס הבטיח תמריצים כספיים למבריחים בישראל, מה שהגביר את המוטיבציה לפעול. בתחילה נהגו המבריחים בזהירות רבה, אך עם הזמן – וככל שהפיקוח לא התהדק – הפכו שאננים יותר. סימנים מחשידים החלו להצטבר, בין היתר כאשר משאיות החלו להגיע בשעות לא מקובלות, תופעה שעוררה דאגה בקרב גורמי הביטחון שהתריעו גם בדיונים כבר בשנה שעברה, עוד לפני שהפרשה נחשפה.
רק כאשר חייל מגולני הבחין בפרט חריג וחשד בהתנהלות חריגה והעביר את המידע הלאה החלה התמונה להתבהר והובילה בסופו של דבר לחשיפת הפרשה.

הנאשם המרכזי בפרשה הוא בצלאל זיני, שהואשם בסיוע לאויב בזמן מלחמה. על פי כתב האישום, זיני הבריח קרטוני סיגריות לרצועה בתמורה ל-365 אלף שקלים, תוך כדי ניצול תפקידו במילואים לסיוע אויב במלחמה, איסור פעולה ברכוש למטרת טרור ולקיחת שוחד. מעצרו הוארך בשבועיים, עד ה-19 בפברואר.
כתבי אישום הוגשו גם נגד אביאל בן דוד בן 31 מקריית גת, חייל מילואים ב"כוח אוריה", ונגד אמיר דב הלפרין בן 38. בכתב האישום נאמר, כי הנאשמים ושותפיהם ידעו שהסחורה המוברחת עשויה להגיע לידי גורמי טרור ובהם החמאס או מי מטעמו, ולשמש ולסייע לחיזוק כוחם ולקידום ומימון פעולתם.
לזיני, שמעצרו הוארך היום בשבועיים, מיוחסים שלושה סבבי הברחות של כ-14 קרטוני סיגריות דרך מעבר סופה, תמורתם קיבל 365 אלף שקלים; להלפרין מיוחסים חמישה סבבים של הברחות, תמורתם קיבל כ-4.3 מיליון שקל; ולבן דוד מיוחסים חמישה סבבים של הברחות, תמורתם קיבל כ-815 אלף שקל. הלפרין ובן דוד, פקודו של זיני שהכניס אותו למערכת ההברחות, הם אלו שהסגירו את זיני והעידו נגדו.
על פי כתב האישום, בצלאל זיני - שמכחיש כל קשר להברחות, אמר לאחד המבריחים לא להגיע עם טלפון וביקש 100 אלף שקלים תמורת ציוד צבאי לחבר ביחידת 8200, בכדי למנוע כדי מאמ"ן לגלות את ההברחות.
סניגוריו של זיני, עורכי הדין עדי קידר ואסף קליין, מסרו כי מרשם טוען לחפותו המלאה וכינו את הטענות המופנות נגדו כ"בדיות". עורכי הדין טענו כי הם יפריכו את סעיפי כתב האישום "אחד אחד".
