כוחות צה"ל עצרו חשודים, וכן החרימו אמצעי לחימה וציוד צבאי שהועברו להמשך טיפול אצל כוחות הביטחון. במחנה הפליטים בלאטה ובעיר שכם, בכפר ג'יפנא ובמחנה הפליטים ג'ילזון שבבנימין עצרו יחידת המסתערבים של מג"ב באיו"ש ביחד עם לוחמי צה"ל מבוקשים.

מתחילת המלחמה נעצרו כ-3,000 מבוקשים ברחבי אוגדת יהודה ושומרון וחטיבת הבקעה והעמקים, מעל ל-1,350 מהם פועלים בשביל ארגון הטרור חמאס.