כוחות מג"ב וצה"ל ניהלו חילופי אש עם מחבלים בשכם, כאשר בסופו המחבלים הסגירו את עצמם לידי כוחות הביטחון שהם מצויידים בשני נשקים מסוג M-16. הכוחות פשטו על המבנה בו התבצרו המחבלים ואיתרו ערכה להפעלת מטענים, מחסניות וציוד צבאי. בנוסף, לפי צה"ל, הלוחמים ירו ופגעו במחבל. כמו כן, הכוחות עצרו תשעה מבוקשים במבצע שנפתח הלילה באלעמרי והחרימו אמצעי לחימה. בהודעת צה"ל נכתב כי "הכוחות ירו בחשוד שהתקרחב לעברם והיווה איום, בזמן הפינוי התברר שמדובר באזרח ישראלי והוא פונה לקבלת טיפול בישראל". עוד נמסר מצה"ל כי בפעילות הכוחות בטמון הלילה כטב"ם תקף חוליית מחבלים שהטמינה מטענים באזור, מחבל נוסף חוסל