משרד הבריאות הודיע הערב (רביעי) על כך שהתיר להפעיל את הרכבות באופן הדרגתי ללא הגבלת נוסעים, אך חזר בו. מנכ"ל המשרד משה בר סימן טוב התנצל בפני בצלאל סמוטריץ' על אי ההבנה בתהליך. ממשרד הבריאות נמסר בתגובה: ״אנו מודעים לצורך לאפשר תחבורה ציבורית, אך לצערנו אנו עדיין לא בשלב בו ניתן לתת אישור להתקהלויות בהיקפים כל כך גדולים וצפופים.
לפי המתווה שגובש לא יוגבלו מספר הנוסעים בכל קרון. אך הדגש יהיה על המלצות לשמירה על בריאות הנוסעים. ההחלטה לא להגביל את מספר הנוסעים התקבלה בגלל שלא ניתן לשלוט בכך בשל ריבוי הקרונות והכניסות אליהם.
בהתאם להנחיות משרד הבריאות, נוסעי הרכבת יידרשו לשמור על ריחוק חברתי, לעטות מסכה ולהימנע מנגיעות בפנים. כמו כן, עליהם להימנע מהנחת ציוד אישי על משטחים ציבוריים, והימנעות מנסיעה במקרה של תסמיני מחלה. כמו כן ממליץ משרד הבריאות לצמצם ככל הניתן מלגעת באופן ישיר במשטחים ציבוריים כגון גלגלות המעבר בין רציפים וביציאה מהתחנות.
לפי התוכנית שהוצעה, תנועת הרכבות תחודש בשני שלבים מרכזיים. ב-17 במאי יופעלו קווים מרכזיים, עם שינויים במסלולי הנסיעה – בימי ראשון עד חמישי בלבד עד לשעה 22:00. עם סיום שלב ההפעלה הראשון בסוף החודש, יורחב השירות ויוחזרו לפעילות קווים ותחנות נוספות.
התחנות שתישארנה סגורות בשלב הראשון: נתניה ספיר, בית יהושע, הרצליה, רעננה מערב, רעננה דרום, הוד השרון סוקולוב, כפ"ס נורדאו, בני ברק, פאתי מודיעין, נתב"ג, י-ם גן החיות, י-ם מלחה, חולון וולפסון, צומת חולון, בת ים יוספטל, בת ים קוממיות, ראשל"צ משה דיין, יבנה מערב, יבנה מזרח, אשדוד עד הלום ודימונה.
