גורם בסביבת נציבת שב"ס קטי פרי אמר לכאן חדשות כי "בן-גביר מנסה לעשות לשלושה בכירים בשב"ס, בהם ראש חטיבת המודיעין, את מה שהוא עשה לעמי אשד, אבל הנציבה לא מאפשרת". לדבריו, "השר רוצה להשתלט על הארגון כדי לדאוג למחבלים יהודים". כך פורסם הערב (שישי) בכאן חדשות.
אחד המשברים בין הנציבה לשר לביטחון לאומי, הוא דרישתו לראיין קצינים מדרגת רב כלאי לפני מינויים, כאשר בסמכות השר לאשר מינויים של סגני גונדרים ומעלה. בסביבת השר בן גביר הגיבו לדברים ואמרו כי "הוא שר מעורב". המשבר האחרון בין השניים היה סירוב השר לבקשת הנציבה להעביר מתפקידו את יועמ"ש שב"ס. גורם בלשכת השר מסר לכאן חדשות כי "אין שבוע שהיא לא ביקשה את זה מהשר".
עוד פורסם הערב כי השר והנציבה טרם שוחחו מאז הגישה את מכתבה, בו הודיעה כי לא תבקש להאריך את כהונתה. המועמדים המובילים להחליף את הנציבה הם מפקד מחוז דרום גונדר חזי מרקוביץ', מפקד מחוז מרכז גונדר אביחי בן חמו, סגן הנציבה גונדר מוני ביטן, שלו הערה מוועדת הבדיקה לבריחה מכלא גלבוע, או מועמד מבחוץ.
בסביבת השר אומרים כי השר מצידו לא התכוון להאריך את כהונתה של הנציבה. לדברי אנשי השר, הנציבה נקמה בו על הבירור שערך לתקרית שהתרחשה בכלא רימונים, בכך שהחמירה את תנאיהם של שני אסירים ביטחוניים יהודים, בניגוד למדיניותו לפיה אסירים ביטחוניים יהודים זכאים לכל הפחות לתנאים של מחבלים.
