ח"כ איציק שמולי ממפלגת העבודה-גשר צייץ בטוויטר תמונה שלו עם בן זוגו ובנם, וכתב בתגובה לדברי שר החינוך: "תביט, הרב רפי, ככה נראית משפחה 'טבעית ובריאה' בתוך מדינה בהפרעה שנתנה לך להיות שר החינוך שלה". גם יו"ר כחול לבן בני גנץ הגיב לדברי השר פרץ בחשבון הטוויטר שלו. גנץ כתב כי "במדינה שלנו בשנת 2020 שר חינוך חייב להחזיק בעמדות שמכבדות את כל הילדים בישראל על דתם, נטיותיהם המיניות ולאומם, ולא לשכוח שכל אדם נברא בצלם".

מועצת התלמידים והנוער הארצית הוקיעה את דברי שר החינוך. בהודעה שפרסמה המועצה, נאמר כי היא תמשיך לפעול למען רווחת בני הנוער בארץ מכל הקהילות, ותפעל להפיכת שיח ציבורי למכיל ומקבל יותר בעבור כל אדם באשר הוא. ארגון המורים והמורות הגאים במערכת החינוך גינה אף הוא את דברי פרץ ואמר כי "מול אותן אמירות חשוכות, הומופוביות וגזעניות יש להזכיר שהשנאה הזו לא מבלבלת ואינה מייצגת אותנו".

מנגד, חבר מפלגת עוצמה יהודית איתמר בן גביר צייץ דברי תמיכה בשר פרץ. בן-גביר כתב כי "העליהום נגד הרב רפי פרץ מלמד עד כמה השמאלנים חוששים ומשתוללים". הוא הוסיף: "לא יעזור לכם, נביא לניצחון הימין בבחירות".