בחירתו של יצחק עמית לנשיא העליון עוררה תגובות סוערות במערכת הפוליטית. אליקים רובינשטיין, המשנה לנשיאת העליון לשעבר אמר היום (שני) ברשת ב: "עמית הוא שופט הגון, מקצועי ומנוסה. יש בכל העניין הזה הרבה שפיכות דמים. התחושה היא שרוצים להרוס את מערכת המשפט ולא לקדם אותה".
רובינשטיין דיבר על ההתנגדות החריפה למינוי עמית לנשיא העליון "צריך גם לשאול למה העניין הזה קפץ דווקא עכשיו? למה הוגשו פתאום 4,000 הסתייגויות? זה שהן מוזמנות".
הוועדה לבחירת שופטים הצביעה בעד בחירתו של השופט עמית לנשיא העליון, בהליך ממנו החליטו להיעדר נציגי הקואליציה. המינוי בוצע לאחר שהוועדה כונסה על ידי הנהלת בתי המשפט, תוך עקיפת סירובו של שר המשפטים לוין לכינוסה. בנוסף, השופט נעם סולברג נבחר למשנה לנשיא העליון.
לאחר בחירת השופט עמית לנשיא העליון סגן ראש הממשלה ושר המשפטים יריב לוין הצהיר כי הוא לא מכיר בעמית כנשיא ולא יכיר בפסיקותיו בבית המשפט.
