אחרי הסערה שעורר, שר החינוך רפי פרץ הבהיר במכתב ששלח הערב (שלישי) למנהלי בתי ספר בתל אביב שהוא מתנגד נמרצות לטיפולי המרה וגם מעולם לא הפנה לטיפולים כאלו - כך פורסם לראשונה בחדשות הערב בכאן 11.
לדברי אנשיו של השר פרץ, בעקבות הסערה שפרצה בעקבות דבריו הוא החליט להעמיק יותר בנושא והבין במה כרוכים אותם טיפולים. לדבריהם, כשנשאל בראיון במוצאי שבת אם טיפולי המרה אפשריים התכוון בתשובתו אך ורק לייעוץ פסיכולוגי או לפנייה לעובדים סוציאליים, ולא לדברים אחרים שנחשף אליהם השבוע.
עוד כתב השר פרץ במכתבו למנהלי בתי הספר: "אני יודע שטיפולי המרה הם דבר פסול וחמור, זוהי עמדתי והיא אינה משתמעת לשני פנים. אני מבין שמדובר בטיפול פולשני שאינו תואם את נפש האדם, מסב למטופלים בו יותר סבל מהקלה, ומגיע אף עד כדי סכנת חיים מאובדנות, שניתן למנוע. עם זאת, זכותם של בעלי נטייה חד מינית לפנות ולמצוא אוזן קשבת ועזרה אצל הגורמים המקצועיים בדרך מכבדת ואוהבת, ולכך כיוונתי בריאיון".